Penjaringan kesehatan dan skrining PTM di SMA Muhammadiyah 3 Yogyakarta dilakukan setiap awal tahun ajaran baru . Kegiatan ini  dilaksanakan secara bertahap.  Tahap pertama akan dilakukan  mulai tanggal 1- 18 Oktober 2024 dikelas - kelas. Pelaksana tahap 1 adalah   TIM UKS meliputi pengisian Lembar Penjaringan Kesehatan yang berisi data siswa lengkap dan beberapa pemeriksaan dasar. Tim UKS akan mengisi sLembar Skrining PTM meliputi data siswa lengkap,  Riwayat Penyakit Keluarga, Riwayat Penyakit Individu, Deteksi Dini PTM, Pemeriksaan Antopometri yaitu Tekanan Darah, Lingkar Lengan, Lingkar Perut, BB/TB dan Pemeriksaan Gula Darah Sewaktu bagi seluruh siswa.

Selanjutnya Tahap 2 dilakukan bersama Puskesmas Wirobrajan dengan melakukan pemeriksaan lanjutan yang  meliputi Pemeriksaan kadar Hemoglobin pada siswi putri, pemeriksaan Mata Hidung Telinga dan Kesehatan Gigi mulut untuk seluruh warga sekolah (siswa , Guru dan tenaga kependidikan). Kegiatan  ini  akan dilaksanakan pada tanggal 21-23 oktober 2024 disentralkan disatu tempat.

Tujuan Penjaringan Kesehatan dan Skrining PTM (Penyakit Tidak Menular) adalah Melakukan Deteksi dini penyakit tidak menular pada warga sekolah.  Selain itu juga Mengetahui riwayat penyakit baik dari keluarga atau individu warga sekolah. Dengan demikian warga sekolah dapat melakukan upaya pencegahan dan meminimalkan resiko terjadinya penyakit yg berkelanjutan.