SMA Muhammadiyah 3 Yogyakarta telah melaksanakan Asesmen Nasional Berbasis Komputer (ANBK) pada hari Senin dan Selasa tanggal 4-5 Agustus 2025. Tujuan utama ANBK (Asesmen Nasional Berbasis Komputer) adalah untuk mengevaluasi mutu pendidikan di Indonesia dengan memotret input, proses, dan output pembelajaran di semua satuan pendidikan. ANBK bertujuan untuk menghasilkan informasi akurat yang dapat digunakan untuk memperbaiki kualitas belajar-mengajar dan meningkatkan hasil belajar peserta didik.

ANBK diikuti oleh 45 peserta didik kelas XI yang telah dipilih secara acak oleh Kemendikdasmen melalui sistem sampling. Kegiatan dimulai pukul 07.20 dan berlangsung di 2 tempat yaitu di laboratorium komputer dan laboratorium DKV, dengan sistem semi-online dan dibagi menjadi dua sesi. Pelaksanaan ANBK 2025 berjalan lancar.