Senin, 20 Juli 2026 dilaksanakan kegiatan upacara bendera pada kelas X dan XI di lapangan upacara kampus 3 SMA Muhammadiyah 3 Yogyakarta. Upacara ini berjalan dengan baik dan sangat hikmat. Hadir sebagai Inspektur upacara pada kesempatan ini adalah dari TNI Angakatan Laut Bapak  Letkol Laut Teknik Wahyu Nugroho Budiharjo, ST.  Dalam amanatnya menyampaikan ucapan terimakasih  atas kesempatan yang diberikan pada hari Senin, 20 Juli 2026 ini berdiri dan menyapa warga sekolah SMA  Muhammadiyah 3 Yogyakarta dalam momentum upacara bendera dan deklarasi bersama warga sekolah SMA/SMK Se DIY Yogyakarta. 
Dalam sambutanya Letkol Laut Teknik Wahyu Nugroho Budiharjo, ST. menyampaikan ajakan bagi pelajar kota Yogyakarta untuk menghindari segala bentuk kenakalan anak usia sekolah yang melampui pelanggaran disiplin  biasa. 
“ Sebagai pelajar hendaknya  tetap  eling dan waspada. Agar kita tetap ingat siapa diri kalian sesungguhnya, ingat pada orang tua  yang menaruh harap dan terus waspada karena banyak bahaya datang yang berujung pada penyesalan”. Tegasnya
Letkol Laut Teknik Wahyu Nugroho Budiharjo, ST. Menegaskan kepada seluruh siswa untuk membuat pilihan yang jelas tentang masa depan dengan memilih pertemanan yang membangun dan berani melapor apabila mendapati dan melihat kekerasan atau narkoba. Pihak pemerintah DIY bersama aparat keamanan, sekolah dan perguruan tinggi juga keluarga akan bergandengan tangan membangun gerakan bersama untuk melindungi pelajar kota Yogyakarta dari pengaruh kenakalan anak usia dini. 
Kegiatan upacara juga di isi dengan deklarasi bersama gerakan anti kekerasan yang dibacakan oleh Ananda Hasna dan ditirukan seluruh peserta upacara. Dengan adanya deklarasi ini diharapkan seluruh siswa dapat berkomitmen untuk menolak kekerasan, narkoba dan minuman keras serta menolak semua bentuk kekerasan dan kenakalan yang dapat merugikan diri sendiri dan orang lain.