SMA Muhammadiyah 3 Yogyakarta terpilih menjadi sekolah model PM dan KKA yang akan dimulai pada tahun ajaran baru tahun 2026/2027. Sebagaimana kita tahu  bahwa Sekolah Model PM dan KKA adalah program strategis Kementerian Pendidikan Dasar dan Menengah (Kemendikdasmen) untuk mentransformasi sistem pembelajaranpembelajaran. Program ini menjadikan sekolah sebagai laboratorium inovasi yang berfokus pada dua pilar utama yaitu PM (Pembelajaran Mendalam) meliputi Pengalaman belajar bermakna di mana siswa memahami, mengaplikasi, dan merefleksikan ilmu yang didapat serta  KKA (Koding dan Kecerdasan Artifisial) berupa  Integrasi kecakapan masa depan untuk melatih cara berpikir logis, sistematis, dan kritis sejak dini. 
Guna menuju kesekolah model PM dan KKA tersebut, SMA Muga mendapatkan pendampingan selama 3 hari mulai Ahad  tanggal 7  sampai Selasa 9 Juni 2026. Pada Ahad 7 Juni pendampingan dilaksanakan secara daring. Sedangkan pada  pendampingan hari ke 2, Senin 7 Juni,  Tim pendamping tiba disekolah model untuk langsung bertemu dengan kepala sekolah dan melakukan koordinasi singkat. Setelah kegiatan tersebut, dilanjutkan dengan bersama sama tim sekolah Model PM dan KKA untuk memberikan briefing dan materi yang dilangsungkan secara internal. Pada Hari ke tiga, tim juga direncanakan bertemu dengan perwakilan peserta didik  dan dilanjutkan dengan penyusunan analisis base line  dan diagnostik sekolah sehingga muncul output berupa data baseline, isu prioritas yang sudah teridentifikasi. Kegiatan diskusi penentuan topik workshop serta penyusunan draf KSP ( Kurikulum satuan pendidikan). Kegiatan hari ketiga diakhiri dengan refleksi bersama dan foto bersama.